メガフリップは無敵中のノックバックを利用してバック宙の飛距離を伸ばす技である。
メガフリップとリコイルフリップはよく似ており、実際飛距離自体は2つとも同じである。しかしメガフリップはガードが不要なのでホバリングの最中でも使用可能という利点がある。
ムジュラの仮面でのメガフリップは時のオカリナとは異なり、猶予が少ない。残像剣を使用していない時はこちらを使用する意味もないためリコイルフリップの仕様を推奨する。メガサイドホップはメガフリップよりもやや簡単であり、高さは出ないものの同じ飛距離を出せる。
メガフリップ中の左右入力することで移動方向を変えることができる。FFAEやグレートベイのボス鍵スキップなどで使用することもある。メガフリップはメガサイドホップよりも難易度が高い。メガフリップ、メガサイドホップは下入力が残っていると速度が落ちてしまうため、発動に下入力が必要なメガフリップはより精密なスティック入力が必要となる。
スティックを離した際、ESSポジションにスティックがある状態で爆発にヒットしたうえでメガフリップに失敗するとクラッシュしてしまうことがある。スティックを離すのではなく素早く上に倒すことでクラッシュの危険を実質無くすることができる。
他の技と同様にこの技でもポーズバッファを使用することができる。下記の動画を参考にフレームを判断すると良い。