様々な方法を使い分けることによってあらゆるムービーがスキップできる(曲やアイテムを入手するムービーの場合、ムービースキップをしてもその曲やアイテムは入手できる)。
技のコツ: ボムチュウをシールドドロップした時にボムチュウが壁を走ってしまう場合は、ボムチュウをシールドドロップするタイミングが早すぎるのが原因である。必ず柱から十分離れて周りに壁がない場所でボムチュウをドロップすること。
炎の神殿から森の神殿にロングワープすれば森のメヌエットのムービーを見ずに森の神殿内に入ることができるが、ここで神殿から外に出るとメヌエットのムービーが発動してしまう。しかし体力 0 の状態で神殿の外に出れば神殿側からでもムービーをスキップできる。
ムービースキップを使い、ボレロを取りつつムービーシーンを飛ばす方法と、ムービーそのものを発動させないことによりボレロの取得をスキップする方法がある。
ダルニアの部屋からデスマウンテン火口に入り、橋の右側へ向かう。そしてそこから近くにある火山にホバーブーツを使って乗り、ムービー発生エリアを迂回しながら先へ進む。
デスマウンテン頂上から火口に入る場合は、メガフリップを使ってワープ用の台座に向かって飛び降りる。これで橋を渡らずに神殿入り口前に行くことができる。ダルニアの部屋から火口に入る場合は、ホバーブーツを使うやり方と同じ位置に立ち、メガフリップを使って火山の上に乗る。
精霊石及びメダルの取得ムービーをスキップできるバグ技。ブルーワープのあるダンジョンで使うことができるが、ジャブジャブ様のお腹は例外的にムービースキップ不可である。詳しくはロングワープのページを参照。
この技のやり方は数種類ある。
1 つ目の精霊石・メダルムービースキップ法。必要なものは B にセットしたフロルの風のみ(どこでも使える状態にはしなくてよい)。任意の場所でフロルの風をセットし、ボス部屋に入る。そしてバック走でブルーワープに向かい、ワープに入る「瞬間」に B を押す。するとブルーワープの中で宙に浮き始めながらフロルの風のメッセージが表示される。画面が白くなり始めるまで待ち、それから B を押してワープする。ワープのタイミングが早すぎると通常のワープになってしまい、メダルが入手できない。しかしワープのタイミングが遅すぎるとワープが発動せずにメダルのムービーが始まってしまう。
2 つ目の精霊石・メダルムービースキップ法。この方法ではカウントダウンタイマー(キノコのタイマーなど)を利用してムービーをキャンセルするが、もう 1 つの方法に比べ、こちらの方が難易度は高い。どちらの方法も「ブルーワープバグ」の応用である。こちらの方法はまずオカリナアイテムを使い、視点が切り替わるまで待つ。この待つ操作はタイマーのカウントダウンを再開させるために必要である(オカリナアイテム発動後すぐにオカリナを解除するとタイマーが止まったままになってしまう)。オカリナアイテム発動時はバック宙をする前の位置を正確に合わせることが重要で、バック宙をしてオカリナアイテムを使った時にブルーワープの端ギリギリに着地するように調整する必要がある。ブルーワープとの距離が近すぎるとそのままワープの中に入ってしまう。また、バック宙をする前にしばらく待ち、オカリナアイテムを発動する時にタイマーの残りが 3~4 秒になるよう調整するとかなり成功率を上げることができる。オカリナアイテムを発動させてタイマーが再びカウントダウンを始めたら、タイマーが残り 00:01 になる瞬間に素早くハートの器を取る。ハートの器は必須ではないが、ハートの器無しで行う場合一気に難易度が上がる(ハートの器を取らない場合はオカリナアイテムを使うタイミングを正確に合わせる必要がある。ハートの器を取る場合はオカリナアイテムのタイミングはいつでも良い)。ハートの器を取ったら B でテキストをスキップしてしばらく待ち、画面が白くなり始めたらテキストボックスを閉じる。
他の方法と原理はほぼ同じ。この方法ではフレーム単位で正確にタイミングを合わせて死亡してムービーをキャンセルし、その後ゲームを続けるを選択する。ブルーワープにはブルーワープタイマーと呼ばれる内部データがあるが、このタイマーはゲームオーバーになり「ゲームを続ける」を選択した後もしばらく動き続けるという特性があり、そしてある一定の数値に達するとメダルや精霊石を入手できる仕組みになっている 。やり方はまず、上の方法と同様にオカリナアイテムをブルーワープの端で発動させる。ただし今回は爆弾で死亡するので事前に体力を 1/2 以下に減らしておくこと。オカリナアイテムを発動させて視点が戻ったら、爆弾を取り出してブルーワープから離れる。この方法を使う場合は十分にブルーワープから離れることが重要である。やがて爆弾が爆発してリンクは死亡し、宙に浮きながら回転し始める。死亡する際は必ず地面に倒れるようにしないと失敗する。死亡のタイミングは Z を押せばある程度調整できる。成功するとムービー発動前にゲームオーバーが発生し、ゲームを続けるを選択すると精霊石またはメダルを入手した状態でダンジョンの入り口に戻ることができる。時々死亡後にリンクが回転することがあるが、こうなるとタイミングを合わせるのが非常に困難になるので注意。また、このムービスキップをデクの樹・ドドンゴの洞窟・炎の神殿で行うと、やや特殊なロングワープが発動する。
ブルーワープのタイマーが特定の数値の時にボス部屋の扉を開いてエリアをロードするとムービースキップが発生する。この方法はデクの樹サマの中・ドドンゴの洞窟・炎の神殿で使用可能。このムービースキップを行うとボス部屋扉によるロングワープが発動する。